安徽医学高等专科学校是经安徽省人民政府、国家教育部批准建立的一所公办全日制普通高等专科学校，教育部、卫生部“卓越医生教育培养计划”试点高校。 

学校前身是创办于1955年的安徽省合肥卫生学校， 2001年6月26日，在安徽省合肥卫生学校、安徽省卫生干部进修学校基础上设置安徽卫生职业技术学院， 2002年3月21日更名为安徽医学高等专科学校。